কাইজার চৌধুরী ১৯৭৫ সালে এএনজেড গ্রিন্ডলেজ ব্যাংকে কর্মজীবন শুরু করেন। এরপর ওয়ান ব্যাংক, এবি ব্যাংক ও মেঘনা ব্যাংকে সিইও হিসেবে দায়িত্ব পালন করেন।